尽管因上海商业储蓄银行旧址保护需要调整施工方案，重新报批，但南京地铁5号线工程的其他区段建设并未因此受到影响。截至8月11日，南京地铁5号线建宁路站土建主体工程顺利实现封顶，包括朝天宫、前庄等7个工点正紧锣密鼓至进行土建工程施工。
虽然地铁5号线项目的工可获批一波三折，但其试验段即先导段早在2015年年底就已经开工建设，经过一年多的施工，这处位于建宁路和规划下关大街交叉口的建宁路站，其土建主体工程于8月6日晚间成功实现封顶。全长37.4公里的地铁5号线，全部为地下线，全线设车站30座。线路起自既有S1线吉印大道站，沿吉印大道向东走行，下穿机场高速，向北下穿九龙湖，之后转向诚信大道向东走行，后向北沿竹山路、土山路铺设，在下穿土山机场、宁杭高铁、京沪高铁及绕城高速后，沿南部新城内部规划国际路和冶修二路行进，接着左转进入光华东街、建康路、升州路，后沿莫愁路、上海路、中山北路北行，下穿郑和中路高架后，向西北转入规划下关大道、规划滨江路，在方家营路路口设终点站方家营站。
根据此前批复的设计方案，南京地铁5号线列车在正线区间最高运行速度为80公里，和地铁1号线、2号线相同，相较今年开通的4号线100公里时速略低。5号线将采用和1号线及2号线相同的A型车，运载能力比4号线一期的B型要大。建成通车后，将采用吉印大道站—方家营站和科宁路站—方家营站大小交路套跑运行，这和目前南京地铁1号线的中国药科大学—迈皋桥和河定桥—迈皋桥的大小交路套跑的运行模式相仿。
据了解，除去已经实现站点主体结构封顶的建宁路站外，目前5号线还有包括前庄站、朝天宫站等7个工点正在进行土建工程施工，其余区段也进行管线改移、绿化迁移和拆迁等各项前期工作。根据工程安排，5号线建设工期为5年，预计2021年建成通车。由于该线路将与已运营及拟建的城市轨道交通线路(11条)和1条城际线路(机场线)换乘，换乘站多达14座，会超过即将开工，拥有13个换乘站的7号线，成为南京地铁线网中名副其实的换乘王。